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台北市第36選區（北松山、中山區）立委補選明年1月舉行，國民黨參選人王鴻薇不斷攻擊民進黨參選人吳怡農有黑道背景、是黑道魁儡。吳怡農13日接受媒體人黃光芹專訪時表示，身邊沒有黑道，「黑名單」的人倒是很多。吳怡農反批王鴻薇選立委是企圖落跑，他的任務就是讓王鴻薇「落跑未遂」。
被問到王鴻薇猛攻黑道、民進黨中常委黃承國等爭議，吳怡農回應，許多攻擊都聚焦在個人，但這件事情應該注意的是，開除民進黨台北市黨部評委會前召集人趙映光兒子趙介佑後的改革，當時社會質疑民進黨人頭黨員問題，若有人頭黨員存在，才會有後面不當勢力問題。
吳怡農指出，王鴻薇不斷攻擊、不實指控，相當可惜，民意代表不應該這樣。台北市黨部在趙介佑事件爆發後做了一系列改革和檢討，他們重新查看每位入黨黨員的申請及檔案，透過公開資料與法院查詢系統，查詢人名、地址是否觸犯排黑條款。
吳怡農續指，人頭黨員不代表黑道，但仍不該存在，否則會鼓勵不當勢力的影響。他們當時針對黨員一一致電確認身分是否為真，民進黨沒有外傳4、5000位人頭黨員問題，台北市黨部在他卸任主委前只有2.5萬位黨員，多數都是因為認同民進黨理念才加入，不該因為一個人讓所有黨員被污名化，這是不公平的。
至於王鴻薇曾譏諷吳怡農是「黑道魁儡」、被黃承國扶持上台北市黨部主委。吳怡農強調，要澄清這件事情很荒謬，他身邊沒有黑道，黑名單倒是很多。當年黑名單上這麼多人爭取來的民主制度，讓每個人都有話語權、聲音與選票，一切的努力及犧牲不是要讓大家抹黑謾罵，也不是社會當時的期待。
吳怡農提到，當年之所以投入黨部主委選舉，是因為自己不屬於任何派系，當時黨部主委選舉被暫停8個月，因為之前2位候選人的競爭太負面，影響到民進黨形象，黨主席才宣布暫停選舉，最後都退選。他出來選舉之後沒有派系鬥爭，因為自己不屬於任何派系，大家質疑他是黑道魁儡很可惜。
關於吳怡農對王鴻薇選上議員沒有就職，就參與立委補選之事，吳怡農說，「其說她是落跑，應該是企圖落跑，我們的任務就是讓她落跑未遂，繼續在議會為松山信義區市民服務」。